El IUMUSAC tiene como objetivos, lo siguiente:
a) Establecer la equidad de género en la educación superior para la construcción de una universidad nacional autónoma y democrática.
b) Proponer medidas efectivas, para la pronta eliminación de todas las formas de discriminación en contra de las mujeres, dentro y fuera de la universidad.
c) Promover la investigación sobre la situación, condición y posición de las mujeres guatemaltecas.
d) Crear nuevos indicadores que permitan medir el avance de la condición, situación y posición de las mujeres universitarias.
e) Incorporar el enfoque de género y feminista en el currículo de estudios para fortalecer la formación integral de las y los profesionales.
f) Fortalecer los programas de formación profesional desde el enfoque de género, feminista y derechos humanos de las mujeres.
g) Potenciar la participación de las mujeres en la conducción de la universidad y en los espacios públicos de la sociedad para construir una democracia con equidad y con justicia educativa.
h) Proponer leyes, políticas públicas y programas que coadyuven a eliminar la opresión, exclusión y discriminación de las mujeres en la sociedad guatemalteca.
Asimismo coadyuvar con acciones afirmativas contenidas en la Política de Equidad de Género en la Educación Superior de la USAC, aprobada por el Consejo Superior Universitario en 2008. Ser el ente rector de la Política universitaria.