El IUMUSAC tiene como objetivos, lo siguiente:

a) Establecer la equidad de género en la educación superior para la construcción de una universidad nacional autónoma y democrática. 

b) Proponer medidas efectivas, para la pronta eliminación de todas las formas de discriminación en contra de las mujeres, dentro y fuera de la universidad. 

c) Promover la investigación sobre la situación, condición y posición de las mujeres guatemaltecas. 

d) Crear nuevos indicadores que permitan medir el avance de la condición, situación y posición de las mujeres universitarias. 

e) Incorporar el enfoque de género y feminista en el currículo de estudios para fortalecer la formación integral de las y los profesionales. 

f) Fortalecer los programas de formación profesional desde el enfoque de género y feminista. 

g) Potenciar la participación de las mujeres en la conducción de la universidad y en los espacios públicos de la sociedad para construir una democracia con equidad y con justicia educativa. 

h) Proponer leyes, políticas públicas y programas que coadyuven a eliminar la opresión, exclusión y discriminación de las mujeres en la sociedad guatemalteca.